基因測序服務提供商Illumina， Inc．（納斯達克股票代碼：ILMN）今日正式宣佈推出StrataMap空間解決方案。這是一款端到端的、基於測序技術的空間轉錄組學研究平台，旨在以前所未有的廣度和分辨率，重新定義研究人員在空間背景下探索全轉錄組的能力。
StrataMap空間解決方案此前被稱為Illumina空間解決方案。它提供了一個集成的完整工作流程，使科學家能夠在單細胞分辨率下，對7.5平方釐米捕獲區域內的大塊組織切片進行無偏倚的全轉錄組分析。與基於探針panel的替代技術相比，StrataMap基於測序的方法每個樣本能檢測到的基因數量多出一倍，並且能夠發現非編碼基因和假基因中隱藏的信號。
該平台在通量、速度及可及性方面均設立了新標準。StrataMap每年可處理超過2000個樣本，測序最短僅需22小時，從樣本到數據洞察的全過程可在五天內完成。更重要的是，它能夠無縫集成到現有的組織病理學工作流程中，並在Illumina NovaSeq和NextSeq平台上運行，為客戶提供了一個易於進入空間生物學領域的入口。
在生物信息學支持方面，StrataMap配備了DRAGEN和Illumina Connected Multiomics軟件。DRAGEN StrataMap流程通過機器學習驅動的細胞分割和轉錄本分配簡化空間探索，而Connected Multiomics平台則通過交互式數據驅動分析，支持將轉錄組數據與基因組、表觀組和蛋白質組數據整合。
早期使用該平台的研究人員已取得重要成果。貝斯以色列女執事醫療中心（BIDMC）的研究團隊利用StrataMap繪製了人類淋巴集合管圖譜，並構建了三維組織模型。英國癌症研究劍橋研究所及劍橋大學的研究團隊則在原發性中樞神經系統腫瘤上成功測試了該平台，其研究涵蓋膠質瘤和膠質母細胞瘤組織，為精準手術和個性化治療提供了新思路。
StrataMap空間解決方案於本月起正式開放訂購，主要面向發育生物學、神經科學及腫瘤學等研究領域。目前該解決方案支持新鮮冷凍組織樣本，適用於真核生物組織。此外，Illumina正在積極開發適用於福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）組織的特異性解決方案，預計將於2027年向初始客戶開放使用。
責任編輯：張俊 SF065